Promotor se nalazi u prokariotima. Promotor (molekularna genetika). Predviđanje regiona promotera
Transkripcija je sinteza RNK na DNK šablonu. Kod prokariota, sintezu sve tri vrste RNK katalizira jedan kompleksni proteinski kompleks - RNA polimeraza.
Sinteza mRNA počinje otkrivanjem RNA polimeraze posebnog područja u molekuli DNK, što ukazuje na mjesto gdje počinje transkripcija - promoter Nakon vezivanja za promotor, RNA polimeraza odmotava susjedni zavoj DNK heliksa. Dva lanca DNK se u ovom trenutku razilaze, a na jednom od njih enzim sintetiše mRNA. Sklapanje ribonukleotida u lanac odvija se u skladu sa njihovom komplementarnošću sa nukleotidima DNK, a takođe i antiparalelno u odnosu na lanac DNK šablona. RNA polimeraza je sposobna da sastavi polinukleotid samo od kraja 5" do kraja 3"; samo jedan od dva lanca DNK može poslužiti kao šablon za transkripciju, odnosno onaj koji je okrenut enzimu svojim krajem od 3" (3" → 5") Takav lanac se naziva kodogenim.
Terminator- ovo je područje gdje se zaustavlja dalji rast lanca RNK i on se oslobađa iz DNK šablona. RNK polimeraza se također odvaja od DNK, čime se obnavlja njena dvolančana struktura.
Fragment molekule DNK, uključujući promotor, transkribovanu sekvencu i terminator, formira transkripcionu jedinicu - transkripton.
Regulacija operona (tj. regulacija na nivou transkripcije) je glavni mehanizam za regulaciju aktivnosti gena u prokariota i bakteriofaga.
Operaon - dio genetskog materijala, čija se transkripcija vrši po molekulu RNK pod kontrolom proteina represora.
Operaon se sastoji od usko povezanih strukturnih gena koji kodiraju proteine (enzime) koji provode uzastopne faze biosinteze metabolita. Svaki operon sadrži: promoter, operator i terminator.
Operater- nukleotidna sekvenca koja se vezuje represorski protein i negativno regulišu transkripcija susjedni gen. Operater se nalazi između promotora i strukturnih gena. Može biti povezan sa posebnim proteinom - represorom, koji sprečava kretanje RNA polimeraze duž lanca DNK i sprečava sintezu enzima. Tako se geni mogu uključivati i isključivati ovisno o prisutnosti odgovarajućih represorskih proteina u ćeliji.
Repressor- regulatorni protein koji potiskuje transkripciju gena operona koji reguliše kao rezultat vezivanja za operatora (regulatorno mjesto operona). To dovodi do prestanka sinteze odgovarajuće mRNA i, posljedično, enzima koje kodira operon. Represor se sintetiše pod kontrolom genskog regulatora u količini od 10 do 20 molekula po ćeliji u obliku aktivnih, odnosno sposobnih da se direktno vežu za operatora, ili neaktivnih oblika. Stvaranje aktivnog represora karakteristično je za inducibilne enzime, čija sinteza počinje tek kada specifične niskomolekularne tvari - induktori - uđu u ćeliju. . Induktor- mali efektorski molekul koji se vezuje za regulatorni protein, ili fizički faktor (svetlost, temperatura) koji stimuliše ekspresiju gena koji su u neaktivnom stanju.
Promotor uključuje niz motiva važnih za njegovo prepoznavanje od strane RNA polimeraze, posebno takozvane sekvence -10 i -35. Promotor je asimetričan, što omogućava RNA polimerazi da započne transkripciju u pravom smjeru i ukazuje koji će od dva lanca DNK poslužiti kao šablon za sintezu RNK.
Region promotora unutar operona može se djelimično preklapati ili se uopšte ne preklapati sa operatorskim regionom cistrona (gena).
Promotor ispod kojeg se nalazi RNA-kodirajući DNK region igra odlučujuću ulogu u intenzitetu ekspresije ovog gena u svakom specifičnom tipu ćelije. Aktivacija promotora određena je prisustvom različitog skupa faktora transkripcije u svakom tipu ćelije
Wikimedia Foundation. 2010.
Sinonimi:Pogledajte šta je "Promotor" u drugim rječnicima:
Akcelerator, aktivator Rječnik ruskih sinonima. promotor imenica, broj sinonima: 2 aktivator (9) ... Rečnik sinonima
PROMOTER, u hemiji, supstanca koja se koristi u malim količinama zajedno sa katalizatorom za povećanje aktivnosti KATALIZATORA. Na primjer, u HABER PROCESU, željezni katalizator se koristi za ubrzavanje reakcije spajanja vodika s dušikom pod ... ... Naučno-tehnički enciklopedijski rečnik
A, m. (njemački: Promotor... Rečnik stranih reči ruskog jezika
Promoter- sekvenca nukleotida u molekuli DNK odgovorna za početak transkripcije... Izvor: Postupak i organizacija kontrole prehrambenih proizvoda dobijenih od/ili upotrebom sirovina biljnog porijekla koji imaju genetsku... ... Zvanična terminologija
promoter- Sekvenca molekula DNK, mjesto inicijacije procesa transkripcije Teme biotehnologije EN promotor... Vodič za tehnički prevodilac
promoter- PROMOTER, PROMOTER a, m. promoter m. njemački Promotor lat. promovirati promovirati. jedinica Inicijator, podstrekač. Do kraja maja odlazimo, pravog plana nema, a iako se Natali smirila, ja sam glavni promoter dugog izlaska na Limanu... ... Istorijski rečnik galicizama ruskog jezika
promoter- Promotor (Promotor) Promotor, sredstvo za aktiviranje Supstanca čiji je dodatak usmjeren na poboljšanje određenog svojstva supstance ili materijala. Na primjer, u katalizi, promotor povećava aktivnost i selektivnost katalizatora, a ponekad ... ... Objašnjavajući englesko-ruski rječnik o nanotehnologiji. - M.
Promotor (promotor) promoter. Područje molekula DNK za koje se vežu molekuli RNK polimeraze
promoter- vodoodbojna; industrija aktivator; promoter Supstanca koja se nanosi na površinu tela da podrži kondenzaciju kapljica (stvaranjem hidrofobnog površinskog sloja) ... Politehnički terminološki rječnik
promoter- promoter (promotor) natkhnennik, kerivnik, pokrovitelj... Rječnik starih i neproživljenih riječi
Promotor-regulatorna sekvenca 5' regije gena, koja određuje mjesto vezivanja RNK polimeraze za DNK. Promotor sadrži dvije sekvence koje igraju važnu ulogu u inicijaciji: TATA kutiju i CCAAT domen. Promotor govori RNA polimerazi gdje da započne sintezu.
102 pitanje. Objasnite pojmove: transkript i transkriptom.
Transkript– molekula RNK nastala kao rezultat transkripcije dijela DNK
Transkripton- ukupnost svih transkripata sintetiziranih od strane jedne ćelije, uključuje mRNA i nekodirajuću RNA
Pitanje: Koje molekule sintetiše RNK polimeraza I?
Sintetiše 5.8srRNA, 18srRNA, 28srRNA
odgovorna za sintezu velikih rRNA, lokalizirana je u nukleolu.
Pitanje: Koje molekule sintetiše RNK polimeraza II?
Sintetizira mRNA, snRNA (nisko-nuklearna), miRNA, miRNA (nisko interferirajuća),
mRNA, lokalizirana je u citoplazmi
Pitanje: Koje molekule sintetiše RNK polimeraza III.
Sintetiše 5sRNA, tRNA, dio snRNA, malu rRNA
Pitanje: Na šta se svodi mehanizam transkripcije (sinteza RNK na DNK šablonu).
Kao rezultat transkripcije, formira se primarna transkriptiRNA.
Pitanje 107: Šta se naziva RNA obrada? Navedite od kojih pojedinačnih procesa se sastoji.
Proces sazrevanja mRNA naziva se procesiranje. Pokrivanje, poliadenilacija, spajanje
Pitanje: Kakva je reakcija spajanja RNA transkripata? Uloga splajsingosoma u ovom procesu.
Spajanje- Ovo je rezanje introna iz mRNA molekula i spajanje egzona pomoću enzima ligaze.
Uspostavljeni makromolekularni proces uključuje veliki broj makromolekula. Makromolekularna struktura je izvedena (splajcingosom->mala nuklearna RNA). snRNA prepoznaju granicu između egzona i introna i vezuju se za njih.
Pitanje 109: Kada dolazi do zatvaranja 5′ kraja RNK kod eukariota i šta to znači? Transkripti čiji su RNA polimeraze podložni zatvaranju.
Odmah nakon transkripcije. Ostatak metiliranog gvanozina je vezan za 5" kraj mRNA; ova struktura se naziva kapa. Kapica olakšava vezivanje mRNA za ribozom u citoplazmi.
Samo transkripti RNA polimeraze II
Pitanje: Navedite sve odredbe o značaju zatvaranja mRNA.
Osigurava efikasnost dalje transkripcije.
Štiti transkript od degradacije 5’-egzonukleazama (5’-5’ veze)
Način daljeg procesa: stimuliše 3'-poliadenilaciju i spajanje.
Potreban za izvoz mRNA iz jezgra
Osigurava vezivanje mRNA za ribozom u citoplazmi
111.Šta je poliadenilacija 3′ kraja mRNA. Kakvu ulogu igra ovaj proces? Transkripti koje RNA polimeraze prolaze kroz ovaj proces.
Poliadenilacija– od 100 do 200 adenil nukleotida se dodaje na 3" kraj mRNA molekula. Formira se poli-A region. Ovaj region stabilizuje molekul mRNA i podstiče njegovo oslobađanje iz jezgra u citoplazmu.
RNA transkripti-polimeraza II
Šta je alternativno spajanje? Kakav biološki značaj ima ovaj oblik spajanja?
alternativno spajanje je oblik spajanja u kojem se spajanje egzona tokom sazrevanja mRNK događa u različitim kombinacijama. U ovom slučaju, redoslijed egzona nije narušen. Spajanje osigurava da geni kodiraju različite proteine, što je mehanizam proteinske raznolikosti kod eukariota (više od 70% ljudskih gena prolazi kroz alternativno spajanje).
Da bi se izvršila ispravna transkripcija, potrebne su dvije vrste regulatornih elemenata. Regulatorni elementi prvog tipa se nazivaju cis regulatori. To su specifične sekvence DNK na datom hromozomu. Cis-regulatori djeluju samo na obližnje gene. Drugi tip se zove transregulatori. To su topljivi molekuli (uključujući proteine i RNK) koje proizvodi jedan gen i koji stupaju u interakciju s drugim genima na istom hromozomu ili na drugim hromozomima. Ako se okrenemo indukciji gena u lac-operon E.coli, tada se možemo prisjetiti da represorski gen proizvodi represorski protein koji stupa u interakciju sa sekvencom operatora za gene lac-operon. U ovom slučaju operater je cis-regulatorni element, jer samo kontroliše lac- operon sopstvenog hromozoma. (Sekvencija mutantnog operatora na drugom hromozomu može, ali ne mora da prikači represorski protein.) Represorski protein, nasuprot tome, je trans-regulator. budući da ga proizvodi jedan hromozom i vezuje se za cis-regulatorni operator na drugom hromozomu (slika 12.5).
Dva tipa nalaze se u eukariotskim genima koji kodiraju mRNA cis-regulatorne DNK sekvence – promotori i pojačivači („pojačivači“). Promoteri obično se nalazi neposredno prije mjesta gdje počinje
Gilbert s. Razvojna biologija: u 3 toma T. 2: Transl. Sa engleskog – M.: Mir, 1994. – 235 str.
142 _______________ POGLAVLJE 12 _____________________________________________________________________________
|
Rice. 12.5. Šema diferencijalne regulacije gena u E. coli; pokazano cis- I trans-regulatorni elementi. U ćelijama divljeg tipa, inducibilno stanje je karakterizirano činjenicom da se RNK za β-galaktozidazu ne transkribuje sve dok laktoza nije prisutna. U nedostatku laktoze, proteina represora (R) kodiranog genom i, pridružuje se web stranici operatera ( O), čime se inhibira transkripcija RNA polimerazom iz promotora ( str). Ako je prisutna laktoza, ona se veže za protein represora, kao rezultat toga represor se ne može vezati za DNK i transkripcija se nastavlja. Rastvorljiva priroda ovog represora dokazana je u eksperimentima na mutantima E. Coli. Kada su haploidne bakterijske ćelije koje nose gen i – , postaju djelomično diploidni sa genom i divlji tip ( i + ), sintetizira se represor divljeg tipa, koji je sposoban da inducibilan izvorni gen ß-galaktozidaze. Ovaj protein represor je trans-regulatorni element. Promotor i operator sekvence su cis-regulatorni elementi. |
|
|
|
Rice. 12.6. Tipičan promotor za eukariotski protein koji kodira gen. Prikazani gen sadrži TATA kutiju i tri 5" promotorska elementa. Primjeri takvih 5' elemenata su prikazani u donjem dijelu slike. (Po Maniatisu et al., 1987.) |
transkripciju, i dugački su oko 100 baznih parova. Region promotora je neophodan za vezivanje RNA polimeraze II i tačnu inicijaciju transkripcije. Pojačivač aktivira iskorišćenje promotora kontrolišući efikasnost i brzinu transkripcije sa tog određenog promotora. Pojačivači aktiviraju samo one koji leže cis-položaj promotora (tj. promotora na istom kromosomu), ali oni mogu funkcionirati na velikim udaljenostima. Osim toga, mogu se nalaziti ne samo na 5" strani gena, već i na drugom lancu DNK (Maniatis et al., 1987).
Promotori gena koji transkribuju relativno velike količine mRNA imaju slične strukture. Oni sadrže sekvencu AΤA (ponekad se naziva TATA kutija ili Goldberg-Hogness kutija), koji se nalazi na udaljenosti od otprilike 30 baznih parova od 5" strane mjesta gdje počinje transkripcija, i jedan ili više prednji promotorski elementi, koji leži još dalje na 5" strani. Uzvodni promotorski element je obično varijacija CAAT sekvence, ali su identificirani i drugi promotorski elementi (Grosschedl i Birnstiel, 1980; McKnight i Tjian, 1986) (slika 12.6).
Po prvi put, promotor gena β-globina je proučavan u eksperimentima za testiranje specifične transkripcije klonirane DNK. Klonirani geni se mogu ispravno transkribovati kada se unesu u jezgra oocita žaba ili fibroblasta ili kada se inkubiraju sa pročišćenom RNA polimerazom u prisustvu supernatanta nukleotida (Wasylyk et al., 1980). Kada je transkripcija gena potvrđena, restrikcijski enzimi se koriste za proizvodnju specifičnih podjela u tom genu ili okolnim regijama. Zatim se može utvrditi da li se modificirani gen nastavlja ispravno transkribirati. Rezultati ovih studija su pokazali da je prvih 109 baznih parova koji prethode cap mestu dovoljno za maksimalnu transkripciju gena ß-globina (Grosveld et al., 1982; Dierks et al., 1983).
Drugi istraživači su razjasnili ovaj zaključak kloniranjem regije mišjeg globin gena od 106. baznog para uzvodno (sa 5" strane) od početka transkripcije (pozicija -106) do 475. baznog para (pozicija +475) u prvi egzon (Myers et al., 1986.) Ovi klonovi su podvrgnuti in vitro mutagenezi kako bi se
Kao polazna osnova za početak specifične, ili smislene, transkripcije. Kod prokariota promotor uključuje niz motiva važnih za prepoznavanje od strane RNA polimeraze, posebno takozvane sekvence -10 i -35. Promotor je asimetričan, što omogućava RNA polimerazi da započne transkripciju u ispravnom smjeru i ukazuje koji će od dva lanca DNK poslužiti kao šablon za sintezu RNK.
Region promotora unutar operona može se djelimično preklapati ili se uopšte ne preklapati sa operatorskim regionom cistrona (gena).
Promotor ispod kojeg se nalazi RNA-kodirajući DNK region igra odlučujuću ulogu u intenzitetu ekspresije ovog gena u svakom specifičnom tipu ćelije. Aktivacija promotora određena je prisustvom različitog skupa faktora transkripcije u svakom tipu ćelije.
Napišite recenziju o članku "Promotor"
Bilješke
Književnost
- Leighton Core, André Martins, Charles Danko, Colin Waters, Adam Siepel i John Lis. . Genetika prirode, novembar 2014. DOI: 10.1038/ng.3142
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Izvod koji karakteriše Promotora
“Veoma mi je drago što te vidim, idi tamo gdje su se okupili i sačekaj me.” - Car je ušao u kancelariju. Knez Petar Mihajlovič Volkonski, baron Štajn, krenuli su za njim, a vrata su se zatvorila za njima. Princ Andrej je, uz dozvolu suverena, otišao sa Paulučijem, kojeg je poznavao još u Turskoj, u dnevnu sobu u kojoj se sastajalo vijeće.Princ Pjotr Mihajlovič Volkonski bio je na poziciji šefa kabineta suverena. Volkonski je napustio kancelariju i, unevši karte u dnevnu sobu i položivši ih na sto, preneo pitanja o kojima je želeo da čuje mišljenje okupljene gospode. Činjenica je da su tokom noći primljene vijesti (kasnije se ispostavilo da su lažne) o kretanju Francuza oko logora Drisa.
Učitavanje...