Il promotore si trova nei procarioti. Promotore (genetica molecolare). Previsione della regione promotrice
Trascrizioneè la sintesi dell'RNA su uno stampo di DNA. Nei procarioti, la sintesi di tutti e tre i tipi di RNA è catalizzata da un complesso proteico complesso: l'RNA polimerasi.
La sintesi dell'mRNA inizia con la scoperta da parte della RNA polimerasi di una regione speciale nella molecola del DNA, che indica il luogo in cui inizia la trascrizione - promotore Dopo essersi legato al promotore, la RNA polimerasi svolge la spira adiacente dell'elica del DNA. Due filamenti di DNA divergono a questo punto e su uno di essi l'enzima sintetizza l'mRNA. L'assemblaggio dei ribonucleotidi in una catena avviene in conformità con la loro complementarità ai nucleotidi del DNA e anche in modo antiparallelo rispetto al filamento modello del DNA. La RNA polimerasi è in grado di assemblare un polinucleotide solo dall'estremità da 5" a quella da 3"; solo uno dei due filamenti di DNA può fungere da stampo per la trascrizione, cioè quello rivolto verso l'enzima con l'estremità da 3" (3" → 5") Tale catena è detta codogenica.
Terminatore- questa è l'area in cui si ferma l'ulteriore crescita della catena dell'RNA e questa viene rilasciata dallo stampo del DNA. Anche l'RNA polimerasi si separa dal DNA, ripristinando la sua struttura a doppio filamento.
Un frammento di una molecola di DNA, comprendente un promotore, una sequenza trascritta e un terminatore, forma un'unità di trascrizione - trascrizione.
La regolazione dell'operone (cioè la regolazione a livello trascrizionale) è il principale meccanismo per regolare l'attività genetica nei procarioti e nei batteriofagi.
Operone - una porzione di materiale genetico, la cui trascrizione avviene per molecola di RNA sotto il controllo di una proteina repressore.
Un operone è costituito da geni strutturali strettamente collegati che codificano proteine (enzimi) che eseguono fasi successive della biosintesi di un metabolita. Ogni operone contiene: un promotore, un operatore e un terminatore.
Operatore- sequenza nucleotidica che si lega proteina repressore e regolante negativamente trascrizione limitrofo gene. L'operatore si trova tra il promotore e i geni strutturali. Può essere associato a una proteina speciale, un repressore, che impedisce alla RNA polimerasi di muoversi lungo la catena del DNA e impedisce la sintesi degli enzimi. Pertanto, i geni possono essere attivati e disattivati a seconda della presenza delle corrispondenti proteine repressori nella cellula.
Repressore- una proteina regolatrice che sopprime la trascrizione dei geni dell'operone che regola in seguito al legame con l'operatore (sito regolatore dell'operone). Ciò porta alla cessazione della sintesi del corrispondente mRNA e, di conseguenza, degli enzimi codificati dall'operone. Il repressore viene sintetizzato sotto il controllo del regolatore genetico in una quantità da 10 a 20 molecole per cellula sotto forma di forme attive, cioè in grado di legarsi direttamente all'operatore, o inattive. La formazione di un repressore attivo è caratteristica degli enzimi inducibili, la cui sintesi inizia solo quando specifiche sostanze a basso peso molecolare - induttori - entrano nella cellula . Induttore- una piccola molecola effettrice che si lega ad una proteina regolatrice, ovvero ad un fattore fisico (luce, temperatura) che stimola l'espressione di geni che sono in uno stato inattivo.
Il promotore comprende una serie di motivi importanti per il suo riconoscimento da parte della RNA polimerasi, in particolare le cosiddette sequenze -10 e -35. Il promotore è asimmetrico, il che consente all'RNA polimerasi di iniziare la trascrizione nella direzione corretta e indica quale dei due filamenti di DNA fungerà da modello per la sintesi dell'RNA.
La regione del promotore all'interno dell'operone può sovrapporsi parzialmente o non sovrapporsi affatto con la regione dell'operatore del cistron (gene).
Il promotore sotto il quale si trova la regione del DNA che codifica l'RNA gioca un ruolo decisivo nell'intensità dell'espressione di questo gene in ogni specifico tipo di cellula. L'attivazione del promotore è determinata dalla presenza di un diverso insieme di fattori di trascrizione in ciascun tipo di cellula
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Sinonimi:Scopri cos'è un "Promotore" in altri dizionari:
Acceleratore, attivatore Dizionario dei sinonimi russi. sostantivo promotore, numero di sinonimi: 2 attivatore (9) ... Dizionario dei sinonimi
PROMOTORE, in chimica, sostanza utilizzata in piccole quantità insieme ad un catalizzatore per aumentare l'attività del CATALIZZATORE. Ad esempio, nel PROCESSO HABER, un catalizzatore di ferro viene utilizzato per accelerare la reazione di combinazione dell'idrogeno con l'azoto sotto... ... Dizionario enciclopedico scientifico e tecnico
A, m. (tedesco: promotore... Dizionario delle parole straniere della lingua russa
Promotore- la sequenza di nucleotidi in una molecola di DNA responsabile dell'inizio della trascrizione... Fonte: Procedura e organizzazione del controllo sui prodotti alimentari ottenuti da/o utilizzando materie prime di origine vegetale che presentano genetica... ... Terminologia ufficiale
promotore- La sequenza della molecola di DNA, il sito di inizio del processo di trascrizione Argomenti di biotecnologia EN promotore ... Guida del traduttore tecnico
promotore- PROMOTORE, PROMOTORE a, m.promotore m. Tedesco Promotore lat. promuovere promuovere. unità Iniziatore, istigatore. Entro la fine di maggio partiremo, non c'è un vero piano, e anche se Natalie si è calmata, sono io il principale promotore di un lungo appuntamento sul Liman... ... Dizionario storico dei gallicismi della lingua russa
promotore- Promotore (Promotore) Promotore, agente attivante Una sostanza la cui aggiunta ha lo scopo di migliorare una determinata proprietà di una sostanza o materiale. Ad esempio, nella catalisi, un promotore aumenta l'attività e la selettività del catalizzatore e, talvolta... ... Dizionario esplicativo inglese-russo sulle nanotecnologie. - M.
Promotore (promotore) promotore. La regione di una molecola di DNA a cui si attaccano le molecole di RNA polimerasi
promotore- idrorepellente; industria attivatore; promotore Una sostanza applicata sulla superficie del corpo per supportare la condensazione delle goccioline (creando uno strato superficiale idrofobico)... Dizionario esplicativo terminologico del Politecnico
promotore- promotore (promotore) natkhnennik, kerivnik, mecenate... Un dizionario di parole antiche e non vissute
Sequenza promotore-regolatrice della regione 5' del gene, che determina il sito di attacco della RNA polimerasi al DNA. Il promotore contiene due sequenze che svolgono un ruolo importante nell'iniziazione: la casella TATA e il dominio CCAAT. Il promotore dice alla RNA polimerasi dove iniziare la sintesi.
102 domande. Spiegare i concetti: trascritto e trascrittoma.
Trascrizione– una molecola di RNA formata a seguito della trascrizione di una sezione di DNA
Trascrizione-la totalità di tutti i trascritti sintetizzati da una cellula, include mRNA e RNA non codificante
Domanda: Quali molecole vengono sintetizzate dalla RNA polimerasi I?
Sintetizza 5.8srRNA, 18srRNA, 28srRNA
responsabile della sintesi di grandi rRNA, è localizzato nel nucleolo.
Domanda: Quali molecole vengono sintetizzate dalla RNA polimerasi II?
Sintetizza mRNA, snRNA (a basso contenuto nucleare), miRNA, miRNA (a bassa interferenza),
mRNA, è localizzato nel citoplasma
Domanda: Quali molecole vengono sintetizzate dalla RNA polimerasi III.
Sintetizza 5sRNA, tRNA, parte di snRNA, piccolo rRNA
Domanda: a cosa si riduce il meccanismo di trascrizione (sintesi dell'RNA su uno stampo di DNA).
Come risultato della trascrizione, si forma un transcriptiRNA primario.
Domanda 107: Cosa viene chiamata elaborazione dell'RNA? Nomina in quali singoli processi è costituito.
Il processo di maturazione dell'mRNA è chiamato elaborazione. Capping, poliadenilazione, splicing
Domanda: Qual è la reazione di splicing delle trascrizioni di RNA? Il ruolo dello splicingosoma in questo processo.
Giunzione- Si tratta del taglio degli introni da una molecola di mRNA e della cucitura degli esoni utilizzando gli enzimi ligasi.
Il processo macromolecolare stabilito coinvolge un gran numero di macromolecole. Viene effettuata la struttura macromolecolare (splicingosoma->piccolo RNA nucleare). Gli snRNA riconoscono il confine tra esoni e introni e si legano ad essi.
Domanda 109: Quando avviene il capping dell'estremità 5' dell'RNA negli eucarioti e cosa significa? Trascrizioni delle quali le RNA polimerasi sono soggette a capping.
Subito dopo la trascrizione. Un residuo di guanosina metilata è attaccato all'estremità da 5" dell'mRNA; questa struttura è chiamata cappuccio. Il cappuccio facilita il legame dell'mRNA al ribosoma nel citoplasma.
Solo trascrizioni della RNA polimerasi II
Domanda: elencare tutte le disposizioni relative al significato del limite dell'mRNA.
Garantisce l'efficienza dell'ulteriore trascrizione.
Protegge la trascrizione dalla degradazione da parte delle 5'-esonucleasi (legami 5'-5')
Un modo per favorire il processo: stimola la 3'-poliadenilazione e lo splicing.
Necessario per l'esportazione dell'mRNA dal nucleo
Fornisce il legame dell'mRNA al ribosoma nel citoplasma
111.Cos'è la poliadenilazione dell'estremità 3' dell'mRNA. Che ruolo gioca questo processo? Trascrizioni di cui le RNA polimerasi subiscono questo processo.
Poliadenilazione– all’estremità da 3" della molecola di mRNA vengono aggiunti da 100 a 200 nucleotidi di adenilato. Si forma una regione poli-A. Questa regione stabilizza la molecola di mRNA e favorisce il suo rilascio dal nucleo nel citoplasma.
Trascrizioni dell'RNA-polimerasi II
Cos'è lo splicing alternativo? Che significato biologico ha questa forma di splicing?
Lo splicing alternativo è una forma di splicing in cui l'unione degli esoni durante la maturazione dell'mRNA avviene in diverse combinazioni. In questo caso l'ordine degli esoni non viene violato. Lo splicing garantisce che i geni codifichino proteine diverse, che è un meccanismo di diversità proteica negli eucarioti (più del 70% dei geni umani subiscono splicing alternativo).
Per effettuare una corretta trascrizione sono necessari due tipi di elementi regolatori. Si chiamano elementi normativi del primo tipo regolatori cis. Sono sequenze di DNA specifiche su un dato cromosoma. Cis I regolatori agiscono solo sui geni vicini. Il secondo tipo è chiamato trans-regolatori. Si tratta di molecole solubili (comprese proteine e RNA) prodotte da un gene e che interagiscono con altri geni sullo stesso cromosoma o su altri cromosomi. Se passiamo all'induzione genetica in lac-operone E.coli, possiamo quindi ricordare che il gene repressore produce una proteina repressore che interagisce con la sequenza operatore dei geni lac-operone. In questo caso l'operatore è cis-un elemento normativo, poiché ha solo controllo lac- operone del proprio cromosoma. (Una sequenza operatore mutante su un altro cromosoma può o meno legare una proteina repressore.) Una proteina repressore, al contrario, è trance-regolatore. poiché è prodotto da un cromosoma e si lega a cis-operatore regolatore su un altro cromosoma (Fig. 12.5).
Due tipi si trovano nei geni eucariotici che codificano l'mRNA cis-sequenze regolatrici del DNA – promotori e potenziatori (“amplificatori”). Promotori solitamente situato immediatamente prima del sito in cui inizia
Gilbert s. Biologia dello sviluppo: in 3 volumi T. 2: Trad. Dall'inglese – M.: Mir, 1994. – 235 p.
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Riso. 12.5. Schema di regolazione genica differenziale in E. coli; mostrato cis- E trance-elementi normativi. Nelle cellule wild-type, lo stato inducibile è caratterizzato dal fatto che l'RNA della β-galattosidasi non viene trascritto finché non è presente il lattosio. In assenza di lattosio, la proteina repressore (R) codificata dal gene io, si collega al sito web dell'operatore ( O), inibendo così la trascrizione da parte della RNA polimerasi dal promotore ( P). Se è presente il lattosio, si lega alla proteina repressore, di conseguenza il repressore non può legarsi al DNA e la trascrizione continua. La natura solubile di questo repressore è stata dimostrata in esperimenti su mutanti E. Coli. Quando le cellule batteriche aploidi trasportano il gene io – , diventano parzialmente diploidi con il gene io tipo selvaggio ( io + ), viene sintetizzato un repressore wild-type in grado di rendere inducibile il gene originale della ß-galattosidasi. Questa proteina repressore è trance-elemento normativo. Le sequenze del promotore e dell'operatore sono cis-elementi normativi. |
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Riso. 12.6. Un tipico promotore di un gene codificante una proteina eucariotica. Il gene presentato contiene una scatola TATA e tre elementi promotori da 5". Esempi di tali elementi 5' sono presentati nella parte inferiore della figura. (Dopo Maniatis et al., 1987.) |
trascrizione e hanno una lunghezza di circa 100 paia di basi. La regione del promotore è necessaria per il legame della RNA polimerasi II e per l'avvio accurato della trascrizione. Il potenziatore attiva l'utilizzo del promotore controllando l'efficienza e la velocità di trascrizione da quel particolare promotore. I potenziatori attivano solo quelli che giacciono cis-posizione dei promotori (cioè promotori sullo stesso cromosoma), ma possono funzionare su lunghe distanze. Inoltre, possono trovarsi non solo sul lato 5" del gene, ma anche su un altro filamento di DNA (Maniatis et al., 1987).
I promotori dei geni che trascrivono quantità relativamente grandi di mRNA hanno strutture simili. Contengono la sequenza AΤA (a volte chiamata TATA box o Scatola Goldberg-Hogness), situato ad una distanza di circa 30 paia di basi dal lato 5" del sito in cui inizia la trascrizione, e uno o più elementi del promotore anteriore, che si trova ancora più lontano sul lato 5". L'elemento promotore a monte è solitamente una variazione della sequenza CAAT, ma sono stati identificati altri elementi promotori (Grosschedl e Birnstiel, 1980; McKnight e Tjian, 1986) (Fig. 12.6).
Per la prima volta, il promotore del gene della β-globina è stato studiato in esperimenti per testare la trascrizione specifica del DNA clonato. I geni clonati possono essere trascritti correttamente quando vengono introdotti nei nuclei degli ovociti o dei fibroblasti di rana o quando vengono incubati con RNA polimerasi purificata in presenza di nucleotidi supernatanti (Wasylyk et al., 1980). Una volta confermata la trascrizione di un gene, gli enzimi di restrizione vengono utilizzati per produrre divisioni specifiche in quel gene o nelle regioni circostanti. Si può quindi determinare se il gene modificato continua ad essere trascritto correttamente. I risultati di questi studi hanno mostrato che le prime 109 paia di basi che precedono il sito cap sono sufficienti per la massima trascrizione del gene della ß-globina (Grosveld et al., 1982; Dierks et al., 1983).
Altri ricercatori hanno chiarito questa conclusione clonando una regione del gene della globina di topo dalla 106a coppia di basi a monte (dal lato 5") dell'inizio della trascrizione (posizione -106) fino alla 475a coppia di basi (posizione +475) nel primo esone (Myers et al., 1986). Questi cloni sono stati sottoposti a mutagenesi in vitro per introdurre
Come trampolino di lancio per l'inizio di una trascrizione specifica o significativa. Nei procarioti il promotore comprende una serie di motivi importanti per il riconoscimento da parte della RNA polimerasi, in particolare le cosiddette sequenze -10 e -35. Il promotore è asimmetrico, il che consente all'RNA polimerasi di iniziare la trascrizione nella direzione corretta e indica quale dei due filamenti di DNA fungerà da modello per la sintesi dell'RNA.
La regione del promotore all'interno dell'operone può sovrapporsi parzialmente o non sovrapporsi affatto con la regione dell'operatore del cistron (gene).
Il promotore sotto il quale si trova la regione del DNA che codifica l'RNA gioca un ruolo decisivo nell'intensità dell'espressione di questo gene in ogni specifico tipo di cellula. L'attivazione del promotore è determinata dalla presenza di un diverso insieme di fattori di trascrizione in ciascun tipo di cellula.
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Appunti
Letteratura
- Leighton Core, André Martins, Charles Danko, Colin Waters, Adam Siepel e John Lis. . Nature Genetics, novembre 2014 DOI: 10.1038/ng.3142
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Un estratto che caratterizza il Promotore
"Sono molto felice di vederti, vai dove si sono riuniti e aspettami." - L'Imperatore entrò nell'ufficio. Il principe Pyotr Mikhailovich Volkonsky, barone Stein, lo seguì e le porte si chiusero dietro di loro. Il principe Andrei, con il permesso del sovrano, andò con Paulucci, che conosceva in Turchia, nel soggiorno dove si riuniva il consiglio.Il principe Pyotr Mikhailovich Volkonsky ricopriva la carica di capo di stato maggiore del sovrano. Volkonsky lasciò l'ufficio e, portando le carte in soggiorno e disponendole sul tavolo, trasmise le domande sulle quali voleva sentire l'opinione dei signori riuniti. Il fatto è che durante la notte giunsero notizie (poi rivelatesi false) del movimento dei francesi attorno all'accampamento di Drissa.
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